MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp36

Total Repeats: 637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017414	TTA	2	6	4	9	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017414	TAACTT	2	12	51	62	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017414	ATA	2	6	87	92	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017414	T	6	6	132	137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017414	A	6	6	190	195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017414	TTA	2	6	197	202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017414	TTA	2	6	216	221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017414	A	7	7	250	256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017414	TA	3	6	261	266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017414	AT	3	6	695	700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017414	A	7	7	712	718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017414	A	6	6	722	727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017414	TATAA	2	10	742	751	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017414	TAATA	2	10	755	764	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017414	AGA	2	6	1104	1109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017414	TTG	2	6	1110	1115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017414	TA	3	6	1185	1190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017414	TAT	2	6	1218	1223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017414	AAT	2	6	1335	1340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017414	AAAT	2	8	1371	1378	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017414	AT	3	6	1383	1388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017414	TAA	2	6	1415	1420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017414	ATT	3	9	1423	1431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017414	CAAA	2	8	1441	1448	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017414	AGA	2	6	1497	1502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017414	T	7	7	1503	1509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017414	TAA	2	6	1524	1529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017414	TCT	2	6	1568	1573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017414	AGA	2	6	1578	1583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017414	A	6	6	1586	1591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017414	TA	3	6	1598	1603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017414	ATTGA	2	10	1644	1653	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017414	TAAAC	2	10	1656	1665	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017414	TAA	3	9	1694	1702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017414	TATT	2	8	1718	1725	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017414	A	6	6	1736	1741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017414	A	8	8	1755	1762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017414	T	6	6	1803	1808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017414	AAT	2	6	1820	1825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017414	AAT	2	6	1830	1835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017414	T	6	6	1894	1899	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017414	GATT	2	8	2039	2046	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017414	T	7	7	2045	2051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017414	A	7	7	2126	2132	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017414	TAA	2	6	2157	2162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017414	ATA	2	6	2255	2260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017414	TAA	2	6	2263	2268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017414	ATTC	2	8	2289	2296	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017414	T	6	6	2297	2302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017414	TATT	2	8	2331	2338	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017414	TCA	2	6	2345	2350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017414	ATTTTG	2	12	2377	2388	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017414	AT	3	6	2421	2426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017414	A	8	8	2475	2482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017414	T	9	9	2491	2499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017414	CAAA	2	8	2501	2508	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017414	AGG	2	6	2538	2543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017414	ATT	2	6	2559	2564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017414	AAT	2	6	2591	2596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017414	A	7	7	2642	2648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017414	T	8	8	2669	2676	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017414	TTA	2	6	2728	2733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017414	TGC	2	6	2788	2793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017414	CTCA	2	8	2815	2822	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017414	GTC	2	6	2848	2853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017414	T	6	6	2854	2859	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017414	TAC	2	6	2943	2948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017414	TTC	2	6	3101	3106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017414	ATTA	2	8	3145	3152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017414	T	6	6	3174	3179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017414	TGA	2	6	3181	3186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017414	GAG	2	6	3210	3215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017414	T	7	7	3251	3257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017414	T	6	6	3271	3276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017414	ATC	2	6	3289	3294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017414	T	6	6	3345	3350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017414	ATT	2	6	3470	3475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017414	CCT	2	6	3520	3525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_017414	ATT	2	6	3544	3549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017414	T	7	7	3622	3628	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017414	T	6	6	3652	3657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017414	CTT	2	6	3674	3679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017414	T	7	7	3683	3689	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017414	T	6	6	3694	3699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017414	T	7	7	3734	3740	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017414	T	7	7	3742	3748	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017414	T	7	7	4136	4142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017414	AAAG	2	8	4195	4202	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017414	T	6	6	4218	4223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017414	T	6	6	4225	4230	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017414	TAAG	2	8	4247	4254	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017414	TGT	2	6	4532	4537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017414	TAG	2	6	4551	4556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017414	TAT	2	6	4604	4609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017414	TCT	2	6	4713	4718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017414	ACTATA	2	12	4771	4782	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_017414	A	6	6	5614	5619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017414	CCT	2	6	6337	6342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_017414	AAT	2	6	6349	6354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017414	AT	3	6	6353	6358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017414	ATTT	2	8	6376	6383	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017414	TTAATA	2	12	6395	6406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017414	TAG	2	6	6422	6427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017414	A	6	6	6466	6471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017414	CAT	2	6	6522	6527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017414	AAG	2	6	6539	6544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017414	ATT	2	6	6580	6585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017414	A	7	7	6605	6611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017414	TAT	2	6	6659	6664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017414	TAT	2	6	6672	6677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017414	TTTA	2	8	6714	6721	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017414	A	8	8	6724	6731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017414	ATT	2	6	6737	6742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017414	T	7	7	6751	6757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017414	ATTT	2	8	6758	6765	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017414	TAAA	2	8	6784	6791	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017414	A	6	6	6819	6824	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017414	A	6	6	6834	6839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017414	ATAA	2	8	6876	6883	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017414	TAA	3	9	6896	6904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017414	AGA	2	6	7016	7021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017414	AAG	2	6	7122	7127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017414	TAA	2	6	7133	7138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017414	AAT	2	6	7184	7189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017414	A	9	9	7206	7214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017414	TTA	2	6	7225	7230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017414	T	6	6	7272	7277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017414	AAC	2	6	7287	7292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017414	AG	3	6	7297	7302	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017414	ATT	2	6	7314	7319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017414	ATT	2	6	7376	7381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017414	TAAA	2	8	7382	7389	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017414	ATT	2	6	7456	7461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017414	GCTA	2	8	7564	7571	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017414	T	6	6	7572	7577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017414	T	6	6	7585	7590	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017414	TATT	2	8	7592	7599	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017414	A	6	6	7606	7611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017414	TA	3	6	7631	7636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017414	CGA	2	6	7645	7650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017414	T	6	6	7657	7662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017414	TAAA	2	8	7664	7671	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017414	TAT	2	6	7736	7741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017414	AGA	2	6	7757	7762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017414	ATT	2	6	9425	9430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017414	A	7	7	9441	9447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017414	A	6	6	9452	9457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017414	T	6	6	9491	9496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017414	TTA	2	6	9502	9507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017414	ATT	2	6	9518	9523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017414	TG	3	6	9527	9532	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017414	T	6	6	9541	9546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017414	AGT	2	6	9584	9589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017414	ATAA	2	8	9620	9627	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_017414	TAA	2	6	9635	9640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_017414	ATTTA	2	10	9659	9668	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_017414	TCT	2	6	9698	9703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_017414	AATA	2	8	9705	9712	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_017414	C	8	8	9722	9729	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
160	NC_017414	TTGT	2	8	9745	9752	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
161	NC_017414	TCTTAA	2	12	9758	9769	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
162	NC_017414	ATTA	2	8	9777	9784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_017414	TA	3	6	9813	9818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_017414	TAC	2	6	10734	10739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_017414	T	6	6	10772	10777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_017414	ATC	2	6	10867	10872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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182	NC_017414	TAT	2	6	13283	13288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_017414	AATA	2	8	13337	13344	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_017414	AT	3	6	13511	13516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_017414	TAT	2	6	13532	13537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_017414	TTA	2	6	13554	13559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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206	NC_017414	T	6	6	14593	14598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_017414	T	6	6	19561	19566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_017414	TTG	2	6	20201	20206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
289	NC_017414	TGC	2	6	20217	20222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
290	NC_017414	TCT	2	6	20223	20228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
291	NC_017414	CTTTT	3	15	20236	20250	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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295	NC_017414	T	11	11	20303	20313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
296	NC_017414	GAA	2	6	20386	20391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
297	NC_017414	CTT	2	6	20401	20406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
298	NC_017414	T	6	6	20405	20410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
299	NC_017414	T	6	6	20416	20421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
300	NC_017414	CTA	2	6	20690	20695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
301	NC_017414	AGT	2	6	20710	20715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
302	NC_017414	TAA	2	6	20725	20730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
303	NC_017414	A	7	7	20773	20779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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305	NC_017414	TA	3	6	20857	20862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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